由於孫楊的超強實力，這枚金牌原本也在中國軍團的計劃之中。但在今晚的比賽開始之前，據央視前方記者劉京京透露，隨着年齡增長孫楊的訓練和賽後體能恢復不如之前幾年，他一度萌生了放棄1500米這一優勢項目的念頭。在今天1500米自由泳決賽前的準備活動進行過程中，電視直播鏡頭始終未能捕捉到孫楊的身影。當1500米自由泳決賽開始前的預備階段，原本屬於孫楊的第3泳道空無一人，這樣他就確定退出了本場決賽。經中國游泳代表團傳出的消息，確認孫楊並無大礙，但因為身體健康原因放棄了本次比賽。孫楊此前已經奪得了本屆世錦賽400米自由泳和800米自由泳的金牌，他本來很有希望成為本屆賽事的“三金王”，但由於遺憾退賽而無緣這一榮譽。最終，1500米決賽的金牌被意大利選手帕爾特里涅利奪得，他的奪冠成績為14分39秒67。
2014年11月24日，新華體育報道稱，孫楊在5月17日一次尿檢中被查出使用了違禁物質曲美他嗪，遭禁賽3個月處罰，時間從5月17日至8月16日。同時，孫楊在全國游泳冠軍賽上的1500米冠軍頭銜被取消，罰款5000元。曲美他嗪為刺激劑，屬於賽內禁用的特定物質，今年1月剛剛被列入世界反興奮劑機構(WADA)禁用清單。含有曲美他嗪的藥物在臨牀上是預防心絞痛的處方類藥物，可以提高心肌細胞能量，改善心臟功能。反興奮劑中心副主任趙健説，在7月的聽證會上，運動員出示了清晰而有説服力的證據，證明曾使用藥物“萬爽力”(鹽酸曲美他嗪片)治療心臟不適，而孫楊也證明了他無意使用這種藥物提高運動表現，因此符合反興奮劑規定條例中減免處罰的標準。雖然孫楊在事件中沒有重大過失，但從嚴格責任的角度看，孫楊作為一名運動員要為進入自己體內的物質負責，接受興奮劑檢查時還應該申報過往用藥。綜合而言，給予孫楊3個月處罰較為合適。
2013年11月3日，孫楊在杭州涉嫌無證駕駛一輛卡宴與公交車相撞,造成一起交通事故。11月4日下午，孫楊被杭州市公安交警部門罰款，並處行政拘留7天。隨後，浙江體育職業技術學院決定對他首先做出了停賽、停訓、暫停一切商業活動和停發津貼的處罰。11月6日，國家體育總局游泳運動管理中心又宣佈對孫楊處以在國家隊內停賽、停訓和停止商業和社會活動的決定。
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